Aerolinka FlyLili do ledna 2025 provozovala vlastní pravidelné linky, avšak od této doby se specializuje výhradně na lety pro cestovní kanceláře a touroperátory do přímořských dovolenkových destinací.
Aerolinka létá primárně do destinací v Turecku, Egyptě, Řecku či Tunisku a spolupracuje s cestovními kancelářemi v Rumunsku, České republice či Polsku.