Xiamenské letiště využívá dvě oddělené terminály, vnitrostátní a mezinárodní, pěší přesun není možný, proto mezi nimi jezdí kyvadlový autobus zdarma s intervaly 10–15 minut a jízdní dobou 10 minut.

Při přestupu z mezinárodního terminálu na vnitrostátní a naopak musíte vyzvednout svá zavazadla, kyvadlovým autobusem přejet mezi terminály a znovu se odbavit.

V případě delšího mezinárodního přestupu musíte rovněž projít čínskou imigrační kontrolou, vyjít ven a znovu se odbavit. Můžete také využít 72hodinového tranzitního víza zdarma. Nesmíte však opustit území města.